Dalam Olimpiade Sains Madrasah Tingkat Provinsi Kalteng Tahun 2012 siswa siswi MAN Buntok berkesempatan untuk mewakili Kabupaten Barito Selatan di Palangkaraya dalam bidang:
- Fisika
- Kimia
- Biologi
- Matematika, dan
- Ekonomi.
Pelaksanaan lomba tersebut di adakan di sekolah MTsN Model Palangkaraya,peserta yang mengikuti lomba berasal dari berbagai daerah. Persiapan sebelum mengikuti lomba MAN Buntok mengadakan bimbingan belajar terhadap siswa siswi yang mengikuti olimpiade dan di bimbing oleh guru-guru yang bersangkutan,di laksanakan nya bimbingan ini untuk membekali siswa siswi agar lebih siap dalam menghadapi olimpiade.
Persaingan pada saat lomba begitu menegangkan namun dengan kepercayaan diri dan ilmu yang di dapat siswa siswi MAN Buntok yakin akan berhasil dalam mengikuti olimpiade. Alhamdulillah dengan usaha dan doa akhir nya siswa siswi MAN Buntok pulang membawakan hasil yang baik,dengan memenangkan Olimpiade di bidang Matematika dan Kimia.